I tarmen finns våra viktiga bakterier och mikroorganismer, det som kallas tarmfloran. Den har flera funktioner och är bland annat en värdefull del av vårt immunförsvar. Så mycket som två tredjedelar av vårt immunförsvar anses sitta i tarmen och om vi har många "goda" bakterier i tarmen hjälper det oss att hålla oss friska.
Den allra första tiden i livet är särskilt betydelsefull för tarmflorans utveckling. Tidigare trodde man att människor föddes utan bakterier i tarmen, men redan vid födseln finns det bakterier i tarmfloran och hur barnet föds har betydelse för utvecklingen. En vaginal förlossning innebär att det nyfödda barnet får tarmbakterier från sin mamma medan barn som föds med kejsarsnitt får bakterier från bland annat mammans hud. Det spelar också roll för barnets tarmflora om det ammar eller om det får bröstmjölksersättning. Om det lilla barnet behöver antibiotika kan det störa tarmflorans sammansättning.